母版页是如何处理相对路径的？如果你使用的是静态文字，这一问题不会困扰你。不过，如果你加入了html标记的标签或者指向其他资源的HTML标签，并且这个文件与母版页不在同一文件夹下面，问题就可能发生。
当你把母版页和内容页放在不同的目录时，问题就发生了。把母版页和内容页分放到不同的目录，这是大型网站推荐使用的最佳实践。实际上，微软建议你在专门的文件夹里保存所有的母版页。不过，如果你不够小心，使用相对路径时会带来问题。
例如，假设你把母版页放在一个叫做MasterPages的子文件夹里，并在母版页里加入了如下的标签：
假设文件MasterPagesa.jpg存在，这看起来是行得通的。在Visual Studio设计环境也会出现图片。但是，如果你在另一个子文件夹里创建了一个内容页，路径就会被解释成相对于那个文件夹。如果a.jpg文件在那个子文件夹不存在，就会得到 一个破损的链接而看不到图片。更糟的是，如果有一幅具有相同文件名的另外一个图片，你会不经意地得到一幅错误的图片。
这样的问题之所以会发生，是因为标签是普通的HTML。所以，ASP.NET不会接触到它。遗憾的是，当ASP.NET创建 内容页的时候，这个标签就不合适了。相同的问题出现在向其他页面提供相对链接的标签以及用来把母版页链接到样式表 的元素。
要解决这一问题，你可以预先把URL写成相对于内容页面的地址。不过这会带来混淆，限制母版页使用的范围，并且产生在设计环境里不正确显示母版页的负面效应。
另一个快捷的解决方案是把图片标签变成服务器端控件，这样ASP.NET就会修复这个错误：
这个解决办法会起作用是因为ASP.NET根据这一信息创建一个HtmlImage服务器控件。这个对象在母版页的Page对象实例化后创建，此时，ASP.NET把所有路径解释为相对于母版页的位置。你可以使用同样的技术来修复标签对其他页面的链接。
你还可以使用根路径语法，并用”~”字符作为URL的开头。例如，下面这个标签毫无歧义地指向网站的根目录下MasterPages文件夹中的a.jpg文件。
遗憾的是，这种语法只对服务器端控件有效。如果你要对普通的HTML产生同样的效果，你需要在链接里包含域名的完整的相对路径。这样的HTML代码难看且不可移植，所以不推荐使用。
摘录自:http://book.51cto.com/art/200809/91060.htm
此外当然你也可以直接利用image或者hyperlink控件来调整，不过对于其他的文件引用，我们还是需要考虑这个问题。
另一个问题，在母版页引入jquery的文件，按照上面的解决方法写成
可是在运行的时候却出错了,说是jquery.js中的第12行的$符号不知道是什么意思,然后我把runat=”server”去掉后就又运行成功了,看来是不能加runat=”server”这个属性了,可是这样的话在另一文件夹中套用母版页的时候又会出现上面这个相对路径的错误了,经到CSDN论坛发贴问,解决方法如下:
即使用了ResolveUr方法…
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